6.C解析:本题考查电化学基础知识。电极a上的有机质转化为CO2,发生氧化反应,所以a为阳极,接电源正极,有机质废水显酸性,图中交换膜为质子交换膜,A项错误MEC工作时为电解池,电解池中阳离子由阳极向阴极迁移,所以H将从a电极室向b电极室迁移,B项错误;a电极上C6H12O3失电子被氧化,生成CO2和H,根据电子守恒和元素守恒可得,电极反应式为C6H2O4-24e+6H2O=6CO2↑+24H,C项正确;有机质中C元素的化合价和甲烷中C元素的化合价不相同,所以a电极室产生的CO2与b电极室消耗的CO2不相等,D项错误