2.A解析:本题考査生物大分子及其功能等有关知识。真核细胞的染色质和染色体是同一物质在不同时期的两种存在形式,主要由DNA和蛋白质组成,都存在DNA与蛋白质的结合,A项正确;真核细胞的核中含有染色体或染色质,存在DNA与蛋白质的结合,原核细胞的拟核中也可能存在,如拟核DNA进行复制或者转录的过程中都存DNA与酶(成分为蛋白质)的结合,B项错误;DNA和DNA水解酶结合后无法调控基因的表达,C项错误;RNA聚合酶是结合在启动子上的,从转录复合体组装开始转录D项错误。