6.B【解析】棒眼的岀现是染色体结构变异,原因是X染色体中的16A区段DNA断裂后发生错误拼接,A正确;
复眼中小眼数量为68的棒眼,细胞中X染色体长度相等,与正常眼相同,因此无法在光学显微镜下观察待测细胞中同源染色体的长度,B错误;
由图可知,与第1幅图(对照组)相比,存在X染色体16A区段重复的果蝇,复眼中小眼的数量均减少,因此16A区段重复具有抑制复眼中小眼数量的作用;随着16A区段数量的增加,复眼中小眼的数量持续减少,因此抑制复眼中小眼数量的作用逐渐增强;由第3、4幅图可以看出,果蝇中16A区段重复的总数日相等,但每条X染色体上16A区段重复数日不同,即16A区段在染色体上的位置不同,果蝇复眼中小眼数量不同,因此果蝇复眼中小眼数量与基因在染色体上的重复位置有关(或染色体对其载有基因的表达具有调节作用),D正确